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《武汉工程大学》 2016年
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家蝇钠离子通道的同源模建和分子对接及3D-QSAR研究

颜琦松  
【摘要】:中国是一个农药应用大国,同时粮食农药残留问题也引起了广泛的关注。由于国家环境保护部门的大力倡导以及相关政府部门的广泛宣传,人们对环境的保护及农药无害化的意识正在加强,对农药的选择和使用也发生了很大的变化,多方面的因素促使着农药的研发正朝着绿色、环保、低毒性的方向发展。拟除虫菊酯属于高效、安全杀虫剂,它通过选择性作用于电压门控钠离子通道(VGICs,Voltage-Gated Sodium Channel),使通道保持在非传导状态,导致昆虫持续麻痹,失去活动能力而死亡。为开发新型除虫菊酯类杀虫剂及研究其作用机理,本论文使用了SYBYL1.2软件,通过同源模建技术以利用大鼠脑电压门控钾离子通道DII区的S4-S5片段的结构和古细菌Aeropyrum pernix的钾离子电压门控通道S6区的结构为模板,通过同源模建的方法构建家蝇的钠离子通道受体开启状态的模型。通过分子动力学模拟与拉氏图,从分子势能和氨基酸所在位置的正确性验证模型的合理性。最后,将31种拟除虫菊酯类化合物与模建的家蝇钠离子通道受体进行分子对接研究,从而探索拟除虫菊酯类化合物与昆虫钠离子通道受体的相互作用机理,此外,还将该系列化合物进行3D-QSAR研究,评价官能团对该系列化合物的影响,为研发低毒型、高效率的钠离子通道受体杀虫剂提供理论依据。
【关键词】:电压门控钠离子通道 家蝇 同源模建 3D-QSAR
【学位授予单位】:武汉工程大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:TQ453
【目录】:
  • 摘要5-6
  • ABSTRACT6-9
  • 第1章 文献综述9-25
  • 1.1 前言9-10
  • 1.2 电压门控钠离子通道的结构10-16
  • 1.2.1 钠离子通道的展开结构10-12
  • 1.2.2 α亚基的分子结构12-14
  • 1.2.3 电压门控钠离子通道的关键区域14-16
  • 1.3 电压门控钠离子通道药物应用的广泛性16-19
  • 1.4 拟除虫菊酯的发现与进展19-25
  • 1.4.1 拟除虫菊酯的历史19-20
  • 1.4.2 新开发的拟除虫菊酯类杀虫剂20-25
  • 第2章 计算机辅助药物分子设计25-35
  • 2.1 计算机辅助药物设计发展25-28
  • 2.2 同源模建28
  • 2.3 分子对接28-30
  • 2.4 3D-QSAR30-35
  • 第3章 家蝇钠离子通道受体同源模建和分子对接及 3D-QSAR研究35-57
  • 3.1 引言35-36
  • 3.2 研究内容36-40
  • 3.3 结果与讨论40-57
  • 3.3.1 同源模建40-41
  • 3.3.2 分子动力学41-44
  • 3.3.3 分子对接44-52
  • 3.3.4 3D-QSAR52-56
  • 3.3.5 实验结论56-57
  • 第4章 四种的拟除虫菊酯与家蝇的钠离子通道受体进行分子对接57-65
  • 4.1 引言57-59
  • 4.2 实验内容59-65
  • 4.2.1 分子对接59
  • 4.2.2 结果与讨论59-65
  • 第5章 论文的总结及展望65-67
  • 5.1 论文总结65
  • 5.2 展望65-67
  • 参考文献67-77
  • 攻读硕士期间已发表的论文77-79
  • 致谢79

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